В 2011 году группа сталкеров подобралась близко к Центру Зоны. В результате случился сильнейший выброс, который полностью изменил Зону. Там, где ранее были безопасные территории, стали появляться аномалии, целые отряды сталкеров оказывались запертыми среди них и погибали. Вместе с тем от аномалий освобождаются ранее недоступные территории. За контроль над ними — и, соответственно, за места появления артефактов и иные стратегически важные точки — разгорается война группировок. Однако Зона становится нестабильной, её часто сотрясают выбросы. Эти и последующие события описывает данная игра.