9‑мм малогабаритный модернизированный автомат СР.3М был разработан в ходе выполнения НИР, а затем ОКР «Внесение» на базе малогабаритного автомата СР3 и специального автомата АС.
В 2004 году автомат СР.3М был принят на вооружение специальных подразделений ФСБ России, а затем и других силовых структур.