Машинное обучение и анализ мутаций SNP - часть 2

“Машинное обучение и анализ мутаций SNP“ Валерий Хаменя (@khamenya), Михаил Косарецкий (@cappelchi). Первая часть обсуждения - Машинное обучение и анализ мутаций SNP () Ребята нам расскажут: 1️⃣ Как подступиться к файлам со снипами *.vcf и получать из них тензор. Акцент будет на очень важном one-hot-encoded (OHE) представлении для снипов. Без такого тензора считать условные вероятности будет очень тяжело. 2️⃣ Как из OHE-тензора строить иерархический остов вероятностного графа для снипов — @ostroumovala 3️⃣ Как сделать нечто любопытное ещё до того, как у нас готов граф. Например, нащупать супер-хабы — локус-варианты, которые вероятностно связаны почти с каждым четвёртым локус-вариантом. ❤️ Самое главное: ищем кто хотел бы поучаствовать. У нас не хватает ни рук, ни времени. Мы очень надеемся, что появятся новые участники в этой дискуссии! Вам будут особенно рады если вы спец по оптимизации простых алгебраических тензорных операций для GPU/TPU PyTorch/Tensorflow. 💌 Если есть